public class JavaApplication31 {
    public static void main(String[] args) {
        try {
            File file = new File("/home/alexander/test_cp1251.txt");
            FileInputStream stream = new FileInputStream(file);
            InputStreamReader reader = new InputStreamReader(stream, "windows-1251");
            char[] buffer = new char[1024];
 
            reader.read(buffer, 0, 1024);
            stream.close();
 
            Pattern pattern = Pattern.compile("(тест\\d+)");
            Matcher matcher = pattern.matcher(new String(buffer));
            while (matcher.find()) {
                System.out.format("match:\"%s\" [%d:%d]%n", matcher.group(), matcher.start(), matcher.end());
            }
        }
        catch (UnsupportedEncodingException ex) {
            Logger.getLogger(JavaApplication31.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
        catch (FileNotFoundException ex) {
            Logger.getLogger(JavaApplication31.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
        catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(JavaApplication31.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }
    }
}

File fo = new File("C:/VKOutput.html");
 
            InputStream is = null;
            try {
                is = method.getResponseBodyAsStream();
            } catch (IOException ex) {
                ex.printStackTrace();
            }
 
            InputStreamReader isr = null;
 
            try {
                isr = new InputStreamReader(is, "windows-1251");//cp1251 пробовал тоже но без толку
            } catch (UnsupportedEncodingException ex) {
                ex.printStackTrace();
            }
 
            Writer w = null;
            try {
                w = new OutputStreamWriter(new FileOutputStream(fo),"UTF-8");
            } catch (UnsupportedEncodingException ex) {
               ex.printStackTrace();
            } catch (FileNotFoundException ex) {
               ex.printStackTrace();
            }
            int x;
 
            try {
                while ((x = isr.read()) != -1) {
                    w.write(x);
                }
            } catch (IOException ex) {
                ex.printStackTrace();
            }
            try {
                isr.close();
                is.close();
                w.close();
            } catch (IOException ex) {
                ex.printStackTrace();
            }

            File file = new File("/home/alexander/test_cp1251.txt");
            FileInputStream stream = new FileInputStream(file);
            InputStreamReader reader = new InputStreamReader(stream, "windows-1251");
            char[] buffer = new char[1024];
            int bufferLength = 0, x;
 
            OutputStreamWriter w = null;
            w = new OutputStreamWriter(new FileOutputStream("/home/alexander/test_utf8.txt"), "UTF-8");
 
            /*
            while ((x = stream.read()) != -1) {
                w.write(x);
            }*/
            do {
                bufferLength = reader.read(buffer, 0, 1024);
                w.write(buffer, 0, bufferLength);
            } while (bufferLength == 1024);
            stream.close();
            w.close();

new String(line.getBytes(), "UTF-8");